Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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NR6A1Q15406 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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NR6A1Q15406 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR6A1Q15406 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR6A1Q15406 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR6A1Q15406 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NR6A1Q15406 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NR6A1Q15406 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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