Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NCAPHQ15003 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms