Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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