Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GY48 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GY48 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GY48 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GY48 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GY48 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GY48 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GY48 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GY48 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GY48 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GY48 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GY48 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GY48 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GY48 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GY48 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GY48 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GY48 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GY48 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GY48 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GY48 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GY48 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GY48 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GY48 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GY48 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GY48 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GY48 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GY48 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GY48 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GY48 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GY48 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GY48 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GY48 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GY48 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
V9GY48 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
V9GY48 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
V9GY48 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
V9GY48 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GY48 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GY48 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GY48 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GY48 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GY48 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GY48 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GY48 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GY48 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GY48 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GY48 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GY48 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GY48 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GY48 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GY48 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GY48 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GY48 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GY48 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GY48 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GY48 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GY48 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GY48 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GY48 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GY48 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GY48 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GY48 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GY48 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GY48 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GY48 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GY48 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GY48 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GY48 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GY48 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GY48 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GY48 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GY48 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GY48 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GY48 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GY48 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GY48 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms