Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms