Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LYVE1Q9Y5Y7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LYVE1Q9Y5Y7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms