Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUDCQ9Y266 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUDCQ9Y266 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms