Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRPC6Q9Y210 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC6Q9Y210 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms