Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMC3Q9UQE7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC3Q9UQE7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms