Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHF8Q9UPP1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHF8Q9UPP1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms