Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms