Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBE1Q9UJT0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms