Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA4Q9UI42 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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