Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5BQ9UGL1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms