Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL9Q9P2J3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms