Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MBD5Q9P267 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MBD5Q9P267 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms