Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARHGEF12Q9NZN5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGEF12Q9NZN5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms