Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GGA3Q9NZ52 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms