Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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HOXC10Q9NYD6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXC10Q9NYD6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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