Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ALKBH4Q9NXW9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ALKBH4Q9NXW9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms