Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG3Q9NT62 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG3Q9NT62 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms