Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMSN1Q9NSI8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms