Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HELLSQ9NRZ9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms