Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PLXNA4Q9HCM2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms