Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms