Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LY9Q9HBG7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms