Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB90

RRAGC, Ras-related GTP-binding protein C, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGCQ9HB90 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RRAGCQ9HB90 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRAGCQ9HB90 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms