Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP3Q9H6T3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms