Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 AC096759.2-202ENST00000515230 777 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 AC079598.2-201ENST00000599191 1294 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SENP3Q9H4L4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP3Q9H4L4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms