Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NBPF3Q9H094 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF3Q9H094 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms