Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFDQ9GZP0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms