Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms