Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms