Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VN1R3Q9BXE9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms