Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS2Q9BVG9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms