Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF1Q9BQI6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms