Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSRNP1Q96S65 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP1Q96S65 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms