Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ALS2Q96Q42 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALS2Q96Q42 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms