Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC17Q96LX7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms