Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM47Q96LD4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms