Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPNS2Q96L46 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms