Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP47Q96K76 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP47Q96K76 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms