Protein–RNA interactions for Protein: Q96K30

RITA1, RBPJ-interacting and tubulin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RITA1Q96K30 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RITA1Q96K30 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms