Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF496Q96IT1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms