Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCANQ96GW7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCANQ96GW7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms