Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM12Q96EX1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMIM12Q96EX1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms