Protein–RNA interactions for Protein: Q93034

CUL5, Cullin-5, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL5Q93034 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CUL5Q93034 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms