Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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RABGGTAQ92696 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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RABGGTAQ92696 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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RABGGTAQ92696 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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RABGGTAQ92696 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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RABGGTAQ92696 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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RABGGTAQ92696 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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RABGGTAQ92696 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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RABGGTAQ92696 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RABGGTAQ92696 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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