Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHF3Q92576 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms