Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TOPBP1Q92547 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms